Thế nhưng, Sup không bất tử. Anh có thể bị tổn thương bởi ma thuật. Vương miện của Wonder Woman, các đòn đánh chứa năng lượng ma thuật vẫn có ảnh hưởng đến Sup. Một chi tiết rất nhỏ trên phim và truyện cho thấy rằng Sup cũng có thể bị âm thanh ở tần số cực cao gây ra tổn thương ở tai.

Một thứ khác có thể ảnh hưởng đến Superman là ánh sáng phát ra từ mặt trời đỏ (một ngôi sao đã sắp hết năng lượng và chuyển sang màu đỏ), ánh sáng này làm Superman suy yếu, thậm chí mất hết sức lực và dễ bị tổn thương giống như người thường.

Đá Kryptonite: Khi hành tinh Krypton phát nổ, nó phân giải thành một vành đai phóng xạ, hình thành những tinh thể Kryptonite cực kì độc hại với cơ thể người Krypton. Nếu Sup dính Kryptonite thì gần như bị mất năng lực, đau đớn và chết. Rời xa vật chất đó thì Sup có thể phục hồi. Kryptonite hầu như là vật chất duy nhất có thể đâm xuyên qua cơ thể của Sup. Có tám loại Kryptonite đã phát hiện: Xanh lục, đỏ, đen, xanh lam, X, hồng, vàng và trắng. Batman và một số nhân vật khác đã sử dụng loại đá này để đánh bại Superman trong một số lần giao đấu. Đặc biệt là Batman có cả một bộ sưu tập các loại vũ khí sử dụng Kryptonite để tiêu diệt hoặc khống chế Superman khi cần (súng bắn đạn Kryptonite, găng tay và áo giáp bọc Kryptonite, hơi ga chứa tinh thể Kryptonite... và thậm chí cả kẹo cao su trộn Kryptonite)